js3845金沙线路基础医学院源自“新疆医科大学厚博学院”的形态学和机能学教研室。2021年1月25日，国家教育部批准厚博学院转设为js3845金沙线路，经过多轮院系机构设置改革，2021年9月正式成立基础医学院。基础医学院下设8个教研室：细胞生物学与遗传学教研室、解剖学教研室、组胚教研室、生理学教研室、生物化学与分子生物学教研室、病理学教研室、病理生理学教研室、病原与免疫学教研室和基础医学实验教学中心。作为医学门类奠基性一级学科，基础医学院支撑了js3845金沙线路临床医学、口腔医学、中西医结合医学、药学等11个专业人才基础医学阶段的培养工作，共开设20门课程，为js3845金沙线路人才培养与社会服务提供了强大的基础支撑。

学院现有专职教师46人，其中教授8人，副教授4人，讲师13人；具有博士学历教师5人。国家级教学名师1人，新疆维吾尔自治教学名师一人，天池特聘教授2人,还有4名教师博士在读。

学院坚持立德树人根本任务，不断深化人才培养模式和教育教学改革，现有自治区级线下一流课程课程1门，自治区级线上线下混合式一流课程2门，校级线下一流课程1门。基础医学学科2022年获批“十四五”新疆维吾尔自治区特色学科培育项目。近3年来，基础医学院获得自治区级和校级教学改革立项22项，校级教学成果奖2项，发表教学研究论文30余篇；主编、参编各类教材7部，其中国家级教材3项；组胚教研室蒋香菊团队荣获第二届全国高校教师教学创新大赛新疆赛区三等奖，校级教师教学创新大赛一等奖，张荣同志获得克拉玛依市“师德标兵”称号，杨波、贺怡、王娜、何丽等同志先后多次获得校级、院级10余次奖项等诸多荣誉。

基础医学院紧跟国际前沿，结合国家重大卫生需求、地区发展与人类健康的需要，开展系列科研工作。近3年学院主持各级科研项目20余项，其中国家自然科学基金项目2项，国家重点研发计划重点专项1项，省部级课题5项，厅局级课题5项。发表SCI期刊源论文9篇，其他论文30余篇；获得发明专利6项，获得实用新型专利6项。

今后，在学校的大力支持下，基础医学院将继续全面改善师资队伍结构，提高科研水平及人才培养质量，建设良好的文化氛围，加强合作与交流，使之成为js3845金沙线路基础医学教学、科研的重要基地。